El Órgano Colegiado Superior (OCS), es el máximo órgano de gobierno de la Universidad Nacional de Loja, encargado de aprobar políticas, planes, estrategias y objetivos que consoliden y fortalezcan la institucionalidad, de conformidad a los lineamientos del órgano rector de la política pública de educación superior. Sus resoluciones son ejecutables para toda la institución.
Las obligaciones del OCS son cumplir y hacer cumplir la Constitución de la República del Ecuador, la Ley Orgánica de Educación Superior, su Reglamento, las Resoluciones del Consejo de Educación Superior, las Resoluciones del Órgano Colegiado Superior, las directrices o normativa expedida por el órgano rector de la política pública de educación superior, el presente Estatuto, los reglamentos internos de la Institución, y demás disposiciones legales.
Miembros del Órgano Colegiado Superior
Representantes del estamento Docentes
| Principal | Alterno 1 | Alterno 2 |
| Paulina Moncayo | John Tucker | Yolanda Celi |
| Marco Montaño | Diana Morocho | Manuel Quezada |
| Karina Calva | Juan Maita | Diana Abad |
| Alex Valdiviezo | Deisy Saraguro | Milton Labanda |
| Natasha Samaniego | Raúl Pineda | Fabiola León |
| Juan Ochoa | Paulina Fernández | Juan Encalada |
| Daniela Calva | Darwin Tapia | Jhoanna Riofrío |
| Kleber Chamba | Yenny Moreno | Juan Cuenca |
Representantes del estamento Estudiantiles
| Principal | Alterno 1 | Alterno 2 |
| Dasna Cueva | Gabriel Peñaherrera | Leidy Condo |
| Josue Chamba | Lisbette Romero | Daniel Novillo |
Representantes de los estamentos Administrativos y Trabajadores
| Principal | Alterno 1 | Alterno 2 |
| Ena Peláez | Geovanny Macías | Zoila Martínez |
